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浙江省內第一臺Affymetrix基因芯片系統。憑借浙江加州國際納米研究院雄厚的科研實力,豐富的服務經驗積累,嚴格的試驗建立了全球標準化的操作規程,涵蓋芯片實驗所需要 的所有工作,實現開放性的芯片實驗及生物信息學等系列新mg电子游戏平臺,竭誠為國內外各高等院校、醫院、生物科技公司的課題研究,提供全方位芯片新mg电子游戏。

本芯片的型號為Mouse430 2.0,總共有4.5萬個轉錄本,有3.4萬個有良好注釋的基因。

客戶只需要提供組織、細胞、即可,從提RNA到純化、質檢、芯片雜交掃描及分析,我們都會為您完成。
a樣品寄送,組織塊建議用干冰或液氮運輸;細胞建議放在trizol中4度或干冰運輸都可。RNA最好溶解在RNase free的水中干冰運輸(如果路程小于30分鐘,可以直接放普通冰上運輸)
(送樣要求:RNA實驗只需要200ng的總RNA即可,濃度不低于70ng/ul, 考慮到QC以及重復需要,希望提供10ul以上的總RNA。260/280希望在1.8-2.2之間。260/230最好在2.0以上,盡量不低于1.0)
b RNA提取與質檢,我們采用最先進的Agilent bioanalyzer跑電泳。(下圖為DNA電泳模擬圖,RNA原理同DNA)

電泳結果如下圖:18S,28S的比值,5S的區域,濃度以及模擬電泳圖

c 芯片雜交與洗滌

判斷芯片是否成功的一些知識:

1. -  四條邊明暗交替模式、拐角棋盤模式
    -  左上角芯片名稱清晰
2.背景平均值(Average Background)和噪音值(Noise Values)
典型的背景平均值范圍在 20 到 100 之間。
來源于相同掃描儀應該有可比較的噪音值。
結果顯示在.rpt 文件中。  
3)   Poly-A Controls: lys,phe,thr,dap
Poly-A  RNA  Controls  用來監控全程的標記過程.  lys,phe,thr,dap  的  3’端都應該表達
(Detection 為 P)。結果顯示在.rpt 文件中。
4)   雜交對照:bioB,bioC,bioD,and cre
bioB,bioC,bioD 代表 E.coli.生物素合成通路中的基因。bioC,bioD,and cre 應該總是檢測到
并以遞增的信號強度表達,來反映它們相對的濃度。結果顯示在.rpt 文件中。
5)   內參照基因 Sig(3’/5’)比值檢測
對于大多數的表達芯片,ß-Actin 和 GAPDH 兩個基因被用來評估樣品制備的質量。二者
探針組的 3’/5’比值至少一個小于 3。ß-Actin 和 GAPDH 的 3’/5’比值顯示在.rpt 文件中。
6)   總體基因的表達率不能低于 20%。
7)   RNA, cRNA QC 電泳圖  符合質控要求


d 數據分析
信號通路分析

信號通路網絡分析


聚類分析